在許多工業(yè)生產(chǎn)上，細(xì)菌是非常重要的東西。制造業(yè)發(fā)現(xiàn)，用細(xì)菌合成某些物質(zhì)，比他們自己用化學(xué)的辦法來合成，來得容易，而且便宜。用細(xì)
菌大量制造的商品有：醋酸、丙酮、丁醇、乳酸和許多種維他命。
細(xì)菌也可以用來處理亞麻和大麻纖維，制造亞麻布，或其他布料、繩索。皮件商品的處理也經(jīng)常用到細(xì)菌，煙草加工也是。
有許多食物產(chǎn)業(yè)需要用到細(xì)菌。對很多日常用品來說，細(xì)菌扮演關(guān)鍵角色，例如，奶油、優(yōu)格和各種起司，例如，瑞士起司的特殊風(fēng)味，就是來
自于細(xì)菌制造的丙酸。
農(nóng)人在制造餵牛的青草飼料時，也會用到細(xì)菌。而且用細(xì)菌取代殺蟲劑，來殺死害蟲的農(nóng)業(yè)技術(shù)也正在發(fā)展中。
在制造抗生素的時候，會用某些真細(xì)菌來控制其他真細(xì)菌，這是格外有趣的作法。我們現(xiàn)今所用的抗生素藥物，大多是用真細(xì)菌制造的，或是可
以從細(xì)菌中找到。這些藥物包括“鍊黴素streptomycin”、“四環(huán)素tetracycline”、“枯草菌素bacitracin”、“新霉素neomycin”。
較新的發(fā)展是，細(xì)菌（例如E.coli）成為基因工程的運輸工具，制造出大量的酵素或其他產(chǎn)品，例如胰島素；應(yīng)用的方法是，先從其他有機體身
上複制基因，然后輸入細(xì)菌宿主身上，來制造產(chǎn)品。
有些真細(xì)菌會造成疾病。說起來，較有名的真細(xì)菌，應(yīng)該是那些造成人類、家畜植物生病的細(xì)菌。我們平常說的“細(xì)菌germs”，有可能是指“細(xì)
菌”，也可能是指“病毒”（有些時候是指真菌、原生動物protozoans、或寄生蟲）。
細(xì)菌會造成疾病的觀念，較早是在19世紀(jì)由巴斯德Louis Pasteur提出的，雖然一開始被嘲笑，但是很快地頂尖科學(xué)家與醫(yī)生都支持他的看法。
真細(xì)菌對人類造成許多種疾病，包括 鼠疫bubonic plague、霍亂cholera、百日喉diphtheria、梅毒syphilis、淋病gonorrhea、痲瘋leprosy、猩
紅熱scalet fever、破傷風(fēng)tetanus、肺炎tuberculosis，以及
傷寒typhoid fever、百日咳whooping cough、細(xì)菌性肺炎bacterial pneumonia、細(xì)菌性痢疾bacterial dysentery、腦膜炎meningitis、鏈球菌
性喉炎strep throat、瘡boil、膿種abscesses…等等。真細(xì)菌也同樣造成其他動物與植物的種種疾病。
